主题网站开发报告,柳州市城乡建设局网站,个人介绍网页制作,英文网站建设公司 杭州网上介绍的那几种直接下载NCBI数据的方法大都下载速度很慢#xff0c;但是EBI (European Bioinformatics Institute) 下载很快#xff0c;而且它的数据库和NCBI是共享的#xff0c;所以我们可以直接从 EBI 下载。
1 、 确定要下载的 SRA 编号#xff1b;
2 、 EBI (https…网上介绍的那几种直接下载NCBI数据的方法大都下载速度很慢但是EBI (European Bioinformatics Institute) 下载很快而且它的数据库和NCBI是共享的所以我们可以直接从 EBI 下载。
1 、 确定要下载的 SRA 编号
2 、 EBI (https://www.ebi.ac.uk/) 搜索 SRA 编号图一点击搜索结果进入详情页面图二然后右键拷贝reads 链接地址然后修改下前缀改为如下格式
修改前ftp://ftp.sra.ebi.ac.uk/vol1/fastq/SRR955/SRR955774/SRR955774_1.fastq.gz
修改后era-faspfasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR955/SRR955774/SRR955774_1.fastq.gz 3、 ascp下载
ascp -i 密钥路径 -l 100M -P 33001 -k 1 -T era-faspfasp.sra.ebi.ac.uk:/vol1/fastq/SRR955/SRR955774/SRR955774_1.fastq.gz .
