上海网站开发报价,1个月能学好网站开发吗,服务器上的wordpress,163网易企业邮箱我把400个无活性的小分子#xff08;decoys#xff09;提交到pharmit里。
命名为decoyset00~decoyset08#xff0c;查找时#xff0c;按这个找。
1、导入药效团配体#xff1a;
进入药效团筛选界面#xff1a; 导入代表药效团模型的活性肽构象#xff1a; 2、选择预先…我把400个无活性的小分子decoys提交到pharmit里。
命名为decoyset00~decoyset08查找时按这个找。
1、导入药效团配体
进入药效团筛选界面 导入代表药效团模型的活性肽构象 2、选择预先设置好的药效团特征空间排列
打开mescollection.xlsx文件根据每个frame里记录的药效团特征信息恢复pharmit网站里的药效团模型 3、对诱导剂分子数据集进行匹配
点击Search CHEMBL32按钮在Contributed Libraries里搜索对应的诱导剂数据集例如这里是decoyset00 点击Search decoyset00等待右侧的匹配结果 出现 在第1页表格里26aa构象里匹配到4个7aa匹配到1个构象。
4、记录匹配到的结果
可以先将第1页表格的数据记录到excel里 逐页更新表格的内容例如第2页表格里26aa又出现3个构象成功匹配模型就将原先4加上3变成7 将每页表格中出现的构象逐一增加到xlsx表格里最后对没有匹配到的构象赋值0完成这一帧模型和这50个诱导剂化合物数据集的药效团检索 5、保存当前的记录存档
点击Save Session记录当前的状态为一个json文件 打开一个空白的pharmit操作页面点击Load Session导入之前保存的json文件就会回到存档位置 结果如下图需点击Search decoyset00重新开始匹配
